这就导致阿布基尔湾的法兰西舰队非常缺乏粮食和水，舰队司令弗朗索瓦.保罗.布鲁伊不得不命令每艘战舰都出动一定的人员，前往岸上各处搜集粮食、饮水。
而在这途中，他们受到了残余的马穆鲁克以及一些贝都因轻骑兵的攻击，搜集粮食和饮水的难度相当大，以至于法军不得不加派人手以确保供给的稳固。
这就使得法兰西军舰长期不满员，几乎所有时刻都缺少三分之一甚至以上的士兵和水手。
重重不利因素迭加之下，你哪怕把霍雷肖.纳尔逊给法兰西，这场海战他们也极难取胜，更别说霍雷肖.纳尔逊还在对面。
于是，当英格兰舰队找到法兰西舰队的时候，纳尔逊在一瞬间就发现了法兰西舰队的第一二个致命缺点，他立刻命令英格兰舰队穿插分割法兰西舰队。
火光冲天而起，爆炸声连远处的亚历山大港都能隐约听见，英格兰舰队很快就完成了分割任务，然后集中兵力夹击法兰西舰队。
法兰西舰队布阵有致命错误，一开打就基本失去了指挥只能各自为战，而关键的水手和炮手又缺员三分之一左右，情况很快就急转直下。
战斗是下午两点开始的，打到晚上九点，法兰西舰队旗舰，拥有118门炮的一级战列舰东方号发生殉爆与火灾，并在不久后沉没，法兰西舰队统帅弗朗索瓦.保罗.布鲁伊也同时葬生火海。
及至第二日凌晨，后舰队指挥官，被莫公泽评价为庸才的维尔纳夫，才借着凌晨的昏暗与雾气率领四艘军舰冲破英格兰舰队的封锁，突围而出。
战斗以法兰西海军的惨败，为结束。
在这场被称为尼罗河口大海战的战斗中，英格兰海军一共十五艘战舰参战，一艘没有被击沉，仅仅战死士兵和水手两百出头，受伤四五百人。
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