后来，两人带着两只精灵，开始在空间中调查，意外地发现，这个空间中竟然有一座图书馆，还有很多宝贵的资料。
其中甚至有一份标记着传说精灵所在地的地图，以及数种精灵的天王、冠军培育方案。
在一番调查后，他们在一个密室中，找到了一些记载。
是某位博士的日记和手稿。
原来这个图书馆，隶属于某个特殊的研究所。
负责这个图书馆的博士，在研究悖论宝可梦。
那台被他们启动，并召唤来两只精灵的机器，就是用来召唤悖论宝可梦的机器。据说可以从过去或未来召唤来宝可梦。
而不同的人能召唤到的悖论宝可梦是不一样的。
有一种抽卡的美感。
司季想要继续召唤，却因为两人不会调整仪器，而无法使用。
因为在召唤出两只精灵后，两台仪器都出现了不同程度的故障。好似是压力太大，仪器过载了。
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